Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CACNB2Q08289 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms