Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTDSPL2Q05D32 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms