Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PTPN12Q05209 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms