Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
OTUD4Q01804 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms