Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SPTBN1Q01082 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms