Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TUBA4AP68366 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms