Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms