Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SMARCA2P51531 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms