Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERFP50548 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERFP50548 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERFP50548 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ERFP50548 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ERFP50548 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ERFP50548 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms