Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATRXP46100 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRXP46100 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRXP46100 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATRXP46100 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATRXP46100 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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