Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGP37231 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGP37231 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PPARGP37231 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PPARGP37231 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGP37231 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms