Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CXCL3P19876 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CXCL3P19876 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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