Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HOXB9P17482 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms