Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 MRPL47-202ENST00000392659 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 LINC01965-201ENST00000412112 1378 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ZNF626-201ENST00000291750 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HOXB1P14653 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms