Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms