Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP2O75323 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms