Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APAF1O14727 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APAF1O14727 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APAF1O14727 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APAF1O14727 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APAF1O14727 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APAF1O14727 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APAF1O14727 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APAF1O14727 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APAF1O14727 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APAF1O14727 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APAF1O14727 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APAF1O14727 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APAF1O14727 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APAF1O14727 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APAF1O14727 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APAF1O14727 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APAF1O14727 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APAF1O14727 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APAF1O14727 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APAF1O14727 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APAF1O14727 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APAF1O14727 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APAF1O14727 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APAF1O14727 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APAF1O14727 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APAF1O14727 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms