Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SOBPA7XYQ1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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