Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC00312Q9Y6C7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00312Q9Y6C7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms