Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMEFF2Q9UIK5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms