Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COPS7AQ9UBW8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
COPS7AQ9UBW8 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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