Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLKQ9UBT6 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms