Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GDE1Q9NZC3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GDE1Q9NZC3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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