Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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FANCFQ9NPI8 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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