Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE7BQ9NP56 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms