Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
KLHL4Q9C0H6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KLHL4Q9C0H6 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms