Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP1-5Q9BYS1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP1-5Q9BYS1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms