Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CARD11Q9BXL7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms