Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MESP1Q9BRJ9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms