Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms