Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GTF3C6Q969F1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms