Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ATG16L2Q8NAA4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms