Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHA9Q7RTU4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms