Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
USP34Q70CQ2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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