Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Q6P435 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Q6P435 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Q6P435 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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