Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRNP1Q6NT89 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRNP1Q6NT89 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms