Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
CARMIL2Q6F5E8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CARMIL2Q6F5E8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms