Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRMS1LQ5PSV4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms