Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL39P5Q59GN2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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RPL39P5Q59GN2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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RPL39P5Q59GN2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL39P5Q59GN2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL39P5Q59GN2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL39P5Q59GN2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL39P5Q59GN2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL39P5Q59GN2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL39P5Q59GN2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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