Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ALFQ53S48 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms