Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
KLHL12Q53G59 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms