Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DUSP28Q4G0W2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms