Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TTLL9Q3SXZ7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms