Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms