Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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