Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Length 529 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CHRNA2Q15822 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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