Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTPRKQ15262 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
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