Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NCF4Q15080 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NCF4Q15080 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms