Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EEA1Q15075 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EEA1Q15075 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
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