Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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